[생물학 실험] 세균의 동정(균동정)

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레포트 > 자연계열
2011.03.23
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소개글

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1. Title : 세균의 동정

2. Date

3. 실험 목적

4. 실험의 원리 및 이론

5. 실험 방법

1) Genomic DNA의 분리 : 16S rRNA를 coding하는 16S rDNA을 cloning하기 위해서

2) PCR (Polymerase chain reaction)

3) 염기서열 결정

6. Results

7. Discussion

8. Reference

본문내용

- 위 실험은 enrichment한 균의 상등액을 취해서 streaking하고 그것의 colony중 다른 두 종의 colony를 각 1개씩 따서 CO 환경 (mineral media)에서 배양한 것을 대상으로 했다.

-(3조) 두 종의 colony에서는 CODH(CO dehydrogenase)가 검출되지 않았으며(lane 11~15), metagenome추출 실험 때 쓰였던 것 에서는 해당 band가 확인되었다. (lane 16, 17)

- Degenerate Primer Sequence

(1) OMPf 5'-GGC GGC TT(C/T) GG(C/G) AA(C/G) AAG GT-3'
(2) BMSf 5'-GGC GGC TT(C/T) GG(C/G) TC(C/G) AAG AT-3'
(3) O/Br 5'-(T/C)TC GA(T/C) GAT CAT CGG (A/G)TT GA-3'

- 채취한 colony 2종과 metagenome에 대하여 1-3 과 2-3 조합으로 나누어 시행하였다.

- (3조) metegenome의 gene에서만 CODH가 검출되었으므로 그것을 template로 하여 16S rDNA sequence실험을 진행하였다.

- (lane 8)1.5kb 부근에서 흐릿하게 band가 확인되었다. (16S rDNA는 1541bp)

7. Discussion

-CODH 검출실험에서 lane 11~14에서 no band인 이유

참고문헌

8. Reference

(Rep-PCR)
http://www.msu.edu/%7Edebruijn/loadr.html
Michigan State University and The DOE- Plant Research Lab

#생물학 #균동정 #동정 #세균 #실험

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