HOME > 농학 > 축산 > 한국축산학회(구 한국동물자원과학회) > 동물자원연구
Bovine SNP50K BeadChip을 이용한 강원지역 한우의 연관불평형 분석
분야 농학 > 축산
저자 홍민욱 ( Min-wook Hong ) , 최소영 ( So-young Choi ) , 김훈 ( Hun Kim ) , 양송이 ( Song-yi Yang ) , 곽경록 ( Kyeongrok Kwak ) , 김종복 ( Jong-bok Kim ) , 이성진 ( Sung-jin Lee )
발행기관 한국축산학회(구 한국동물자원과학회)
간행물정보 동물자원연구 2017년, 제28권 제2호, 46~55쪽(총10쪽)
파일형식 05407163.pdf [다운로드 무료 PDF 뷰어]
판매가격 0원
적립금 0원 (구매자료 3% 적립)
이 자료를
논문의 미리보기 2페이지를 PDF파일로 제공합니다.
 
연관 논문
강원랜드 리조트카지노의 강원지역에 대한 경제적 파급효과와 영향력 분석 - 조사기법에 의한 지역산업연관모델을 중심으로
지역산업연관표 추정을 위한 비조사기법의 유용성 비교 - 확률계수행렬 접근법을 중심으로
강원지역의 지역내산업연관분석을 이용한 파급효과에 관한 연구 -
베이지안 회귀를 이용한 국내 홀스타인 젖소의 유량형질 관련DGAT1유전자 효과 검증
국내은행의 점포수 변화와 변동요인 분석
 
 
국문초록
본 연구는 한우의 전장유전체 내에 존재하는 단일염기 다형성(SNP)에 대해 DNA chip 분석을 통해 각 개체의 유전자형을 파악하고, SNP 표지인자간 연관불평형의 크기를 알아보기 위해 실시하였다. 강원도에서 사육되고 있던 한우 거세우 139두의 조직을 채취하여 DNA를 추출하였으며, Bovine SNP50K BeadChip 분석을 이용하여 분석에 사용 가능한 최종 35,769개의 SNP 표지인자를 얻어 연관성 분석을 실시하였다. 분석에 이용된 SNP 표지인자의 총 길이는 2499.26Mb이었고, 전장 유전체에서 평균 대립유전자빈도(MAF)는 0.273이었으며, SNP 표지인자간의 평균 거리는 0.060과 0.082 사이에 분포하였다. 강원지역 내 한우거세우를 이용하여 확인한 본 실험 결과는 기존의 전국의 한우를 대상으로 한 연구결과와 유사한 패턴을 보였다. 50Kb 이하로 인접한 거리를 갖는 SNP 표지인자들의 연관불평형 값(r2)이 0.2 초과인 인자가 34%로 나타났다. 또한 SNP 표지인자간 거리가 멀수록 측정값이 떨어지는 지수형식의 그래프를 보였다. 염색체별로 구분한 40kb 이하로 인접한 SNP표지인자의 연관불평형 값(r2)은 0.2 이하로 나타난 것이 총 7개(13, 15, 19, 23, 25, 28, 29번 염색체)였다. 종합하여 볼 때, 본 연구 결과는 강원한우의 유전적 개량을 이용한 기초자료로서 활용될 수 있을 것이며, 유전적 개량을 이용한 육종시스템에 도움을 줄 수 있을 것으로 기대된다.
 
 
영문초록
This study was conducted with DNA chip analysis to investigate genotypes of SNPs in genome wide association (GWA) of Korean native cattle (Hanwoo) in Gangwon region and extent of linkage disequilibrium (LD) among SNP markers. Genomic DNA for genotyping was extracted from the tissue samples of Hanwoo steers (n=139). A total of 54,609 SNPs were screened using Bovine SNP50K BeadChip. The filtering resulted in 35,769 useful SNPs, which were used for LD analysis. The total length of the SNP markers used in the analysis was 2499.26 Mb, the mean of minor allele frequency was 0.273 and the average interval distances of adjacent SNP markers by each chromosome was 60 to 82 Kb in GWA. The results of this study which confirmed by using Hanwoo steer in Gangwon, showed a pattern similar to previously reported studies for Hanwoo. Greater than 0.2 of LD value (r2) observed 34 percentage at adjacent SNP markers within 50 Kb. Also graph showed an exponential trend the decay of LD with physical distance. When the decay of r2 with a distance was plotted separately for each chromosome, the average r2 values were lower than 0.2 on BTA 13, 15, 19, 23, 25, 28, and 29 in the less than 40 Kb when compared to all other chromosomes. Therefore this study could be utilized as baseline data using genetic improvement, helpful in a genetic breeding system for Gangwon Hanwoo.
 
 
Hanwoo, Linkage disequilibrium, Single nucleotide polymorphism, Genome wide association
 
 
도움말
본 논문은 참고용 논문으로 수정 및 텍스트 복사가 되지 않습니다.
 
 
추천자료
[협상로] 과학적, 사회적 관점에서의 한미 쇠고기협상 분석
[영남대] 국제문화의이해 중간기말(타이핑) 포함입니다.★
광우병 정의, 원인, 역사, 감염경로, 전파방법, 잠복기간, 임상증상, 진단, 치료, 피해 사례, 인간 광우병, 유럽 광우병, 국내 문제점, 검역 강화 조치, 문제점, 개선 방안, 시사점
[공무원면접] 시사상식
[유통]삼성 테스코 홈플러스
[졸업][노인복지]실버산업의 현황과 발전방향에 관한 연구
[부동산]주택보급율 100%달성 이후 한국 부동산시장 변화 방향
[유통관리]까르푸의 유통정보시스템분석
[마케팅원론]그린마케팅과 사례분석
[정치학]중앙일보의 실록 박정희 시대 발췌문
오늘 본 자료
오늘 본 자료가 없습니다.
장바구니 담은 자료
장바구니가 비어 있습니다.
이 간행물 인기자료
Bovine SNP50K BeadChip을 이용한 강...
반추동물용 섬유질배합사료(TMR) 제조...
물리화학적 처리가 양돈장 악취저감에...
DNA Degradation이 Genotyping-by-Seq...
Effects of Dietary Supplementation ...
이 간행물 신규자료
물리화학적 처리가 양돈장 악취저감에...
Bovine SNP50K BeadChip을 이용한 강...
사료 내 에너지 수준 및 비테인 첨가 ...
한우의 혈액시료 처리 방법(시간, 온...
구제역 진단법 연구개발 현황 (총설)
저작권 정보
본 학술논문은 한국학술정보㈜ 각 학회간에 저작권 계약이 체결된 것으로 HAPPY학술이 제공하고 있습니다. 본 저작물을 불법적으로 이용시는 법적인 제재가 가해질 수 있습니다.
 
서비스이용약관 | 개인정보취급방침 | E-mail 수집 거부 | 제휴 및 광고문의 | FAQ
이메일 무단 수집 거부
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나 그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며, 이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사처벌됨을 유념하시기 바랍니다. [게시일 2003년 4월 2일]