대다수 미생물들의 다양성과 이들의 생태학적인 역할에 대한 올바른 이해와 함께 이들의 효과적인 활용을 위해서 다른 거시적인 접근방법이 필요하게 되었다. 이런 중에 도입되기 시작한 방법이 metagenome 연구로, 비교적 연구의 역사는 길지 않은 편이지만 최근 가시적인 연구 성과들이 발표되고 있다.
What is Metagenome?
자연계에 존재하는 수많은 미생물의 genome이 서로 섞여 있는 상태
토양과 해수, 갯벌, 하천, 대기, 가축의 대장 등 다양한 자연 환경으로부터 채취한 미생물의 DNA가 서로 혼재돼 섞여 있는 형태
Glossary
DNA(deoxyribonucleic acid): 유전물질
Gene: 유전자(유전인자)
Chromosome: 염색체(DNA+단백
1. Title : (2주차) Metagenome 의 추출
2. Date: 2007/09/11
3. 목적 : CO로 enrichment한 세균의 metagenome을 추출하여 본다.
4. 원리 및 이론
- Metagenome : metabolic enzyme +genome
- metagenome의 이용 : 배양이 되지 않는 미생물의 metagenome을 추출하여 E.coli에 넣어서 배양한다.
- 균의 규명 : 16S rRNA를 이용하여 identification한
♣ Title
- "Metagenome" 의 추출
♣ Introduction
미생물은 지구상에 존재하는 전 생물종의 약 60%를 차지하고 있는 것으로 알려져 있으며 이러한 미생물은 지구 생태계를 유지하는데 없어서는 안 될 중요한 역할을 담당하고 있다. 미생물은 또한 고부가가치 생물자원으로서 생명공학 산업의 핵심소
♣ Introduction
우리가 CO에서 자라는 세균을 동정하기 위해 emrichment와 pure culture 를 시켜 얻은 샘플과 metagenome 샘플을 얻었었다. 이 중 우리조는 metagenome 샘플의 PCR를 통해서 CO 세균의 DNA를 확인할 수 있었다. 이렇게해서 얻은 16SeDNA의 sequencing을 위해 업체에 의뢰해야 하지만, 이 상태로 바로 데이터를