[생물학실험] METAGENOME 추출

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레포트 > 자연계열
2008.02.12
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[생물학실험] `Metagenome` 의 추출

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소개글

[생물학실험] METAGENOME 추출에 대한 자료입니다.

1. Title
2. Date
3. 목적
4. 원리 및 이론
5. 실험방법
6. Results
7. Discussion
8. Furtherstudy
9. Reference

본문내용

1. Title : (2주차) Metagenome 의 추출

2. Date: 2007/09/11

3. 목적 : CO로 enrichment한 세균의 metagenome을 추출하여 본다.

4. 원리 및 이론

- Metagenome : metabolic enzyme +genome
- metagenome의 이용 : 배양이 되지 않는 미생물의 metagenome을 추출하여 E.coli에 넣어서 배양한다.
- 균의 규명 : 16S rRNA를 이용하여 identification한다.
ribosome은 30S small subunit과 50S large subunit으로 구성되어 있고 50S unit은 23S와 5S rRNA가 있고, 30S unit에서는 16S rRNA가 있다.
(16S rRNA를 이용한 미생물 분류방법은 further study에 기술)

- Kit를 이용한 DNA분리

5. 실험방법

User Protocol

1) soil sample 0.25gm을 tube에 넣는다
2) gently vortex (bead를 이용해 물리적으로 cell wall을 깬다.)
3) C1 check. 침전물이 있으면 60도로 가열한다.
(C1은 계면활성제로 SDS가 들어있어서 cell wall을 깬다. 화학적으로 침전물을 녹인다.)
4) C1 60㎕ 를 넣고 간단히 vortex
5) 수평vortex한다. maximum speed로 10분한다.

참고문헌

- biochemistry.yonsei.ac.kr 연세대학교 의과대학 분자생물학 강의
- Brock's Biology of Microorganisms 10th Ed.
- 서강대학교 생명과학과 조유희 교수 (webpage)

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